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某些发酵原料在发酵前含有大量固形物，发酵后也有一部分固形物没有消化，这些固形物可以为饲料或肥料例如酒精生产废水和禽畜粪便中的固形物就是很好的肥料或饲料在目前设计的大中型沼气工程中，都强调了前处理和后处理部分，这两部分的主要功能之一就是分离料液中的固形物。根据原料的不用利用价值，可在沼气发酵前分离出来，开展综合利用，也可以在发酵后将未分解利用完的固体分离出来再加以利用。
沼气微生物代谢产物可分为两部分。*一部分为沼气，它产生后自动与料液分离。第二部分是保存在发酵料液中的物质。因作为产品开发，沼气微生物代谢产物是有较大开发潜力。
沼液中的氮均已氨态氮的形式存在，这对于优先吸收硝态氮或硝态氮与氨态氮并行吸收的蔬菜作物来说，不能直接利用，必须先经过硝化细菌的作用，将氨态氮转化成氨态氮。聊城绿能新能源有限公司